مائع بایپسیوں کا خون، نہ ہی ٹیومر ٹشو استعمال کرتے ہیں- کینسر کی تشخیص کرنے کے لئے
عام طور پر، ٹیوس بایو بایسیوں کا استعمال کرتے ہوئے کی جانچ پڑتال کی جاتی ہیں. ٹومور اور جینٹائپڈ سے ایک چھوٹا نمونہ لیا جاتا ہے، یا جینیاتی شررنگار کا تجزیہ کرتا ہے. اس نقطہ نظر کے ساتھ مسئلہ یہ ہے کہ بائیو بائیسنگ ٹومین کو مشکل ہوسکتا ہے. اس کے علاوہ، ایک ٹیومر بایپسسی ٹییمر کا صرف ایک سنیپ شاٹ فراہم کرتا ہے.
2015 ء میں ڈسکیک میڈیسن میں لکھنا، لیگگا اور شریک مصنفین روایتی ٹیومر بائیوکیسی کے بارے میں مندرجہ ذیل ہیں:
واضح وجوہات کی بناء پر، ترتیب کے مطابق بایپسیوں کی طرف سے ٹیومر ارتقاء کی نگرانی کرنا مشکل ہے. اس کے علاوہ، بایپسسی صرف ٹیومر کے ایک ہی جگہ کو آئین دیتا ہے اور اس وجہ سے بڑے طومار میں کسی قسم کی تبدیلیوں کے پورے سپیکٹرم کی نمائندگی نہیں کرسکتی ہے. ایک متبادل ایک ہی ٹیومر کے لئے ایک سے زیادہ بائیو بوسیوں کو حاصل کرنے کے لئے ہوگا، لیکن یہ اختیار ناگزیر اور نہ ہی درست لگتا ہے.
مائع بایپسیسی کینسر کے ساتھ مریضوں سے حاصل ہونے والے خون کے نمونے میں ڈی این اے (CTTNA) اور دیگر ٹیومر بیکٹروڈس کی پیمائش کی شامل ہیں. یہ ابھرتی ہوئی تشخیصی نقطہ نظر تیز رفتار، ناقابل اعتماد اور لاگت مؤثر ہونے کا وعدہ کرتا ہے.
مائع بائیسوسی کی تاریخ
1948 میں، منڈل اور میٹیس، ایک جوڑی فرانسیسی محققین نے سب سے پہلے صحت مند لوگوں کے خون میں CTTNA کی شناخت کی. یہ دریافت اس وقت سے آگے تھا، اور یہ دہائیوں تک تک نہیں تھا کہ CTTNA مزید تحقیقات کی.
1977 میں، لیون اور ساتھیوں نے سب سے پہلے کینسر کے مریضوں کے خون میں CTTNA کی زیادہ مقدار کی شناخت کی.
1989 کی طرف سے، Stroun اور ساتھیوں نے خون میں نوپلاک (یعنی، کینسر) کی خصوصیات کی شناخت کی. ان دریافتوں کے بعد، کئی دوسرے گروہوں نے ٹیومر سپائسرز اور اونکجن، مائکروسیٹائٹ وابستگی، اور ڈی این اے مییتائلشن میں مخصوص تبدیلیوں کی نشاندہی کی، جس سے ثابت ہوا کہ CTTNA ٹومینز کی طرف سے گردش میں رہ گیا ہے.
اگرچہ ہم جانتے ہیں کہ ٹی ٹی اے اے اے اے ٹییمر کے خلیوں سے نکالنے والے خون میں گردش ہوتی ہے، اصل میں، رہائی کی شرح، اور اس ڈی این اے کی رہائی کے میکانیزم واضح نہیں ہے، تحقیقاتی تنازعات کے نتیجے میں تحقیق کے ساتھ. کچھ تحقیق سے پتہ چلتا ہے کہ زیادہ غریب تیمور زیادہ مردہ کینسر کے خلیات پر مشتمل ہوتے ہیں اور زیادہ ctDNA جاری کرتے ہیں. تاہم، کچھ تحقیق سے پتہ چلتا ہے کہ تمام خلیات ctDNA کو آزاد کرتی ہیں. اس کے باوجود، یہ لگتا ہے کہ کینسر کے ٹماٹروں نے CTTNA کے خون میں CTTNA کی سطح بڑھا دی ہے، جس میں سی ٹی ڈی این کینسر کا ایک اچھا باہمی کارکن ہے.
خون میں بھاری ٹکڑے ٹکڑے اور کم توجہی کی وجہ سے، CTTNA الگ الگ اور تجزیہ کرنا مشکل ہے. سیرم اور پلازما کے نمونے کے درمیان ctDNA کی توجہ مرکوز کی ایک توپ ہے. ایسا لگتا ہے کہ خون پلازما بجائے خون سیرم ctDNA کا بہتر ذریعہ ہے. Umetani اور ساتھیوں کی طرف سے ایک مطالعہ میں، CTTNA توجہ مرکوز کے دوران سیزم کے مقابلے میں مسلسل ڈی این اے گردش کرنے کے ممکنہ نقصان کی وجہ سے پلازما میں کم کم پایا جاتا تھا، کے طور پر coagulation اور دیگر پروٹین نمونہ کی تیاری کے دوران ختم کیا جا رہا ہے.
Heitzer اور ساتھیوں کے مطابق، یہاں کچھ مخصوص مسائل ہیں جو ctDNA کی تشخیصی صلاحیت کو حل کرنے کے لئے حل کرنے کی ضرورت ہے:
سب سے پہلے، پرانیاتی طرز عمل کو معیاری ہونا ضروری ہے .... ایک تنصیب کے طریقہ کار کا انتخاب ہے جو کافی مقدار میں اعلی معیار کے ڈی این اے کی نکالنے کو یقینی بناتی ہے اور یہ ظاہر ہوتا ہے کہ خون کے نمونے اور پروسیسنگ کے پرانی فزیکل عوامل کو ڈی این اے کی پیداوار کو مضبوطی سے متاثر کر سکتا ہے .... دوسرا، سب سے اہم مسائل میں سے ایک مقدار مقدار کے طریقوں کے ہم آہنگی کی کمی ہے. مختلف مقدار کی پیمائش کے طریقوں، ... مختلف نتائج پیدا کرتے ہیں کیونکہ ان کی پیمائشوں کو مجموعی طور پر یا صرف پرانے ڈی این اے کا نشانہ بنایا جاتا ہے .... تیسری، کم سے کم اور CTTNA کی رہائی کے تفصیلی میکانزم کے بارے میں جانا جاتا ہے، اور زیادہ تر مطالعے میں انکشافی واقعات میں جو سی ٹی ڈی این کی رہائی میں بھی حصہ لے سکتی ہے.
ھدف بنانا بمقابلہ غیر محفوظ شدہ طریقوں
فی الحال، ctDNA کے لئے خون پلازما (یا سیرم) کا تجزیہ کرتے وقت دو اہم نقطہ نظر موجود ہیں. پہلا نقطہ نظر نشانہ بنایا جاتا ہے اور ٹیومرز کے اشارہ مخصوص جینیاتی تبدیلیوں کو دیکھتا ہے. دوسرا نقطہ نظر غیر موثر ہے اور کینسر کی ctDNA عکاس کے لئے ایک جینوم وسیع پیمانے پر تجزیہ شامل ہے. متبادل طور پر، exome ترتیب ایک زیادہ سرمایہ کاری مؤثر، غیر ھدف شدہ نقطہ نظر کے طور پر استعمال کیا گیا ہے. Exomes ڈی این اے کے حصے ہیں جو پروٹین بنانے کے لئے ٹرانسمیشن ہیں.
ھدف شدہ نقطہ نظروں کے ساتھ، سیرم ڈرائیور کے متغیرات کے ایک چھوٹے سے سیٹ میں معروف جینیاتی متغیرات کے لئے تجزیہ کیا جاتا ہے.
ڈرائیور متغیرات جو جینوم میں مبتلا ہوتے ہیں جو کینسر کے خلیات کو فروغ دینے، یا "ڈرائیو" کو فروغ دیتے ہیں. ان متغیرات میں KRAS یا EGFR شامل ہیں.
حالیہ برسوں میں تکنیکی ترقی کی وجہ سے، چھوٹے پیمانے پر ctDNA کے لئے جینیوم کے تجزیہ پر ھدف شدہ نقطہ نظر ممکن ہو چکا ہے. ان ٹیکنالوجیوں میں آر ایس ایم ایس شامل ہیں (پروموشن فارغ الکولیشن کا نظام)؛ ڈیجیٹل پی سی آر (ڈی پی سی آر)؛ موتیوں کی مالا، ایمولینس، پروموشن، اور مقناطیسی (بیامنگ)؛ اور گہری ترتیب (CAPP-Seq).
اگرچہ ٹیکنالوجی میں پیش رفت ہوئی ہے اگرچہ ھدف شدہ نقطہ نظر ممکن ہو، ھدف شدہ نقطۂ نظر صرف متعدد پوزیشنوں کے نقطہ نظروں کو ہدف دیتا ہے اور بہت سے ڈرائیوروں کے متغیرات جیسے ٹیومر سپروسر جینز کو بھی چھو جاتا ہے.
مائع بائیسسی کے لئے غیر ھدف شدہ نقطہ نظر کا بنیادی فائدہ یہ ہے کہ یہ حقیقت یہ ہے کہ ٹیسٹ دوبارہ باقاعدگی سے جینیاتی تبدیلیوں پر متفق نہیں ہے، کیونکہ تمام مریضوں میں استعمال کیا جا سکتا ہے. فوری طور پر جینیاتی تبدیلیوں کو تمام کینسروں کا احاطہ نہیں کرتا اور مخصوص کینسر کے دستخط نہیں ہیں. تاہم، یہ نقطہ نظر تجزیاتی حساسیت کا حامل نہیں ہے اور ٹیومر جینوموز کے جامع تجزیہ ابھی تک ممکن نہیں ہے.
نوٹ، پورے جینوم کی ترتیب کی قیمت میں کافی کمی آئی ہے. 2006 میں، پورے جینوم کی ترتیب کی قیمت تقریبا 300،000 ڈالر (USD) تھی. 2017 تک، قیمت میں جینوم فی 1،000 ڈالر (امریکی ڈالر) گر گئی، بشمول ریجینٹ اور آرڈرنگ مشینوں کے تخرکشک سمیت.
مائع بائیسوسی کی کلینیکل افادیت
CTTNA استعمال کرنے کی ابتدائی کوششیں صحت مند مریضوں میں کینسر کے مریضوں یا جنہوں نے بینگن کی بیماری کے ساتھ تشخیصی اور موازنہ کی سطح کی تھی. ان کوششوں کے نتائج مخلوط تھے، صرف بعض مطالعات جن میں کینسر، بیماری سے پاک حیثیت، یا تنازعات کی نشاندہی کرنے میں اہم فرق دکھایا گیا تھا.
اس وجہ سے ctDNA صرف کینسر کی تشخیص کرنے کے لئے کچھ وقت استعمال کیا جا سکتا ہے کیونکہ CTTNA کی متغیر مقدار ٹیومر سے حاصل ہوتی ہے. ایک ہی رقم میں تمام ٹیومر "شیڈ" ڈی این اے نہیں. عام طور پر، زیادہ جدید، وسیع پیمانے پر ٹیومر نے ابتدائی، مقامی، ٹیومر کرنے سے زیادہ ڈی این اے کی گردش میں بہایا. اس کے علاوہ، مختلف ٹیمر اقسام نے ڈی سی اے کی گردش میں مختلف مقدار میں بہایا. ٹییمر سے حاصل کیا جاتا ہے ڈی این اے گردش کرنے کا حصہ 0.01٪ سے 93٪ تک، مطالعہ اور کینسر کی اقسام میں متغیر متغیر ہے. یہ نوٹ کرنا اہم ہے کہ، عام طور پر، صرف ایک اقلیت سی ٹی ڈی این کے ٹییمر سے حاصل کی جاتی ہے، باقی باقی عام ٹشووں سے آتے ہیں.
ڈی این اے کو سنبھالنے کے لئے بیماری کے پروجناسک مارکر کے طور پر استعمال کیا جا سکتا ہے. وقت کے ساتھ کینسر میں تبدیلیوں کی نگرانی کرنے کے لئے ڈی این اے کی گردش کا استعمال کیا جا سکتا ہے. مثال کے طور پر، ایک مطالعہ سے پتہ چلتا ہے کہ دو سالہ بقایا مریضوں کو کولورٹیکل کینسر کے ساتھ مریضوں میں (یعنی مریضوں کی تعداد کم از کم دو سال بعد میں کولورٹیکل کینسر کے ساتھ تشخیص کے بعد زندہ رہنے کی وجہ سے) اور KRAS ہاٹپٹ متغیرات میں ان لوگوں میں 100 فی صد تھا. متعلقہ گردش ڈی این اے. اس کے علاوہ، یہ ممکن ہے کہ قریب مستقبل میں، ڈی این اے گردش کرنے کے لئے استعمال کیا جاسکتا ہے کہ وہ صحت سے متعلق زخموں کی نگرانی کریں.
ڈی سی اے کو بھی تھراپی کے جواب کی نگرانی کے لئے استعمال کیا جا سکتا ہے. کیونکہ ڈی این اے گردش کرنے والے ٹییمورس کے جینیاتی تبدیلی کی بہتر تصویر کی پیش گوئی کرتے ہیں، یہ ڈی این اے کی تشخیصی ڈی این اے پر مشتمل ہے، جس میں استعمال ہونے والی تشخیصی ڈی این اے کی بجائے ٹیمرز خود سے حاصل ہوتی ہے.
اب، چلو بایپسی کے کچھ مخصوص مثالوں پر نظر آتے ہیں.
Guardant360
گارڈارڈنٹ ہیلتھ نے ایک ایسا ٹیسٹ تیار کیا جو 73 کینسر سے متعلق جینوں کے لئے متقابلیات اور کروموسومل ریارگرنٹس کے لئے ڈی این اے کی گردش کرنے والی پروفائل پر اگلے نسل کی ترتیب کا استعمال کرتا ہے. گارڈنٹین ہیلتھ نے آنلوولوجی میں مائع بایپسی کی افادیت کی ایک رپورٹ شائع کی. اس مطالعہ نے خون کے نمونے کو 15،000 مریضوں کو مشترکہ 50 ٹیومر اقسام کے ساتھ استعمال کیا.
زیادہ تر حصے کے لئے، ٹائپ بائیو بائیس میں منعقد جینی تبدیلیوں سے منسلک مائع بائیسسی ٹیسٹ کے نتائج.
این آئی ایچ کے مطابق:
گارڈڈنٹ 360 نے اہم کینسر سے متعلقہ جینوں جیسے EGFR، BRAF، KRAS ، اور PIK3CA میں اسی اہم متغیرات کی نشاندہی کی ہے، جو پہلے سے ہی ٹیومور بائیوسوسی نمونے میں تشخیص کی گئی تھی، اسی طرح 94٪ سے 99 فی صد سے متعلق ہے.
اس کے علاوہ، NIH کے مطابق، محققین نے مندرجہ ذیل رپورٹ کی:
مطالعہ کے ایک دوسرے جزو میں، محققین نے تقریبا 400 مریضوں کا اندازہ کیا تھا- جن میں سے زیادہ تر فنگر یا کولورٹیکل کینسر تھے جنہوں نے خون میں ctDNA اور ٹیومر ٹشو ڈی این اے کے نتائج حاصل کیے تھے اور جینیومک تبدیلیوں کے نمونے کے مقابلے میں. ٹومور بائیوپس کی تجزیہ کے نتائج کے مقابلے میں مائع بائیسسی کی مجموعی درستگی 87 فیصد تھی. خون اور ٹیومر کے نمونے ایک دوسرے کے 6 ماہ کے اندر جمع کیے گئے تھے جب درستگی میں 98٪ اضافہ ہوا.
Guardant360 درست تھا اگرچہ خون میں ڈی این اے گردش کی سطح کم تھی. اکثر اوقات، ٹیومر ڈی این اے کی گردش صرف خون میں ڈی این اے کا 0.4 فی صد بناتا ہے.
مجموعی طور پر، مائع بایپسی کا استعمال کرتے ہوئے، گارڈارڈ کے محققین نے ٹیومر مارکروں کو شناخت کرنے میں کامیاب کیا تھا جو 67 فی صد مریضوں میں ڈاکٹروں کے علاج سے براہ راست علاج کرسکتے تھے. یہ مریضوں کو ایف ڈی اے منظور شدہ علاج کے ساتھ ساتھ تحقیقاتی تھراپی کے اہل تھے.
ctDNA اور لنگھن کینسر
2016 میں، ایف ڈی اے نے کوباس ای جی آر ملٹی ٹیسٹنگ کی منظوری دے دی جس میں پھیپھڑوں کے کینسر کے مریضوں کی گردش ڈی این اے میں EGFR متغیرات کا پتہ لگانے کے لئے استعمال کیا جاتا ہے. یہ ٹیسٹ پہلا ایف ڈی اے منظور شدہ مائع بایپسی تھا اور اس مریضوں کی نشاندہی کی جا سکتی تھی جو ایولوٹینب (ترسوفا)، افطنیب (گلٹروف)، اور گفیتینب (آئریہ) کا استعمال کرتے ہوئے پہلے سے ہی علاج کے ذریعے ہدف شدہ علاج کے لۓ امیدوار ہوسکتے ہیں، اور osimeritinib (Tagrisso) دوسرا لائن علاج یہ اہداف علاج خاص طور پر EGFR متغیرات کے ساتھ کینسر کے خلیات پر حملہ کرتے ہیں.
اہم بات، جھوٹے منفی نتائج کی وجہ سے، ایف ڈی اے کی سفارش کی گئی ہے کہ ایک ٹشو بائیسسی نمونہ بھی مریض سے لے جاسکتا ہے جو منفی مائع بایپسی ہے.
CtDNA اور لیور کینسر
گزشتہ 20 سالوں میں جگر کی کینسر سے مرنے والی تعداد میں اضافہ ہوا ہے. فی الحال، جگر کا کینسر دنیا میں کینسر کی موت کا دوسرا اہم سبب ہے. جگر، یا ہیپاپیکویلر (ایچ سی سی)، کینسر کا پتہ لگانے اور تجزیہ کرنے کے لئے دستیاب کوئی بایومیٹرک موجود نہیں ہیں. ڈی این اے کو سنبھالنے کے لیور کینسر کے لئے ایک اچھا بایومیارکر ہو سکتا ہے.
لیبا کینسر کی تشخیص کرنے کے لئے گردے ڈی این اے کا استعمال کرتے ہوئے لگبا اور مندرجہ ذیل کوٹیشن سے مندرجہ ذیل کوٹیشن پر غور کریں:
RASSF1A، P15، اور P16 کے ہائیڈرمیٹائل کو ریٹائرڈویسی مطالعہ میں ابتدائی تشخیصی آلات کے طور پر تجویز کیا گیا ہے جس میں 50 ایچ سی سی مریض شامل ہیں. چار ابردارانہ میتلیڈیٹ جینوں کا دستخط (اے پی سی، جی ایس ایس پی 1، RASSF1A، اور SFRP1) بھی تشخیصی درستگی کے لئے آزمایا گیا تھا، جبکہ RASSF1A کے میتھولیشن پروپوزل کی گذارش بائیومارکر کے طور پر رپورٹ کیا گیا تھا. بعد میں مطالعہ نے ایچ ٹی سی اے کے مریضوں میں گہری ترتیب تکنیکوں کا استعمال کرتے ہوئے سی ٹی ڈی این کا تجزیہ کیا .... افسوسناک طور پر، ڈی ایچ اے کاپی نمبرز کو ایچ سی سی کے پچھلے تاریخ کے بغیر خون کی مجموعی تاریخ کے بغیر دو ایچ بی وی کیریئرز میں پتہ چلا گیا تھا، لیکن اس نے کون سی پی سی کی پیروی کی. اس تلاش میں، سی سی ڈی اے اے کے ابتدائی ایچ سی سی کا پتہ لگانے کے لئے ایک اسکریننگ کے آلے کے طور پر کاپی نمبر مختلف حالت کا اندازہ لگایا گیا تھا.
ایک لفظ سے
مائع بایپسیوں جینومیک تشخیص کے لئے ایک نیا نیا نقطہ نظر ہے. فی الحال، مخصوص مائع بایپسیوں، جس میں جامع آلودگی کی پیشکش پیش کی جاتی ہے، ٹشو بائیسسی سے حاصل جینیاتی معلومات کو مکمل کرنے کے لئے ڈاکٹروں کو دستیاب ہیں. کچھ بھی مائع بائی بائیس بھی ہیں جو ٹشو بائیسسی کے جھوٹ میں استعمال کیا جا سکتا ہے- جب ٹشو بائی بائیس دستیاب نہیں ہیں.
اس بات کو ذہن میں رکھنے کے لئے ضروری ہے کہ بہت مائع بایپسی آزمائشی اس وقت جاری رہیں اور اس مداخلت کے علاج کی افادیت کو گوشت سے نکالنے کے لئے مزید تحقیقات کی ضرورت ہے.
> ذرائع:
> تیمور میں جینیاتی تبدیلیوں کے لئے خون کا ٹیسٹ تیم بائیسسی کے متبادل کے طور پر وعدہ کرتا ہے. این آئی ایچ.
> ہیٹرٹزر ای، اللو پی، جیگلی جے بی. کینسر کے لئے مائع بائیسوسی کے طور پر تیمور ڈی این کو گردش کرنا. کلینیکل کیمسٹری. 2015؛ 61: 112-123. Doi: 10.1373 / کلینکم .4 .4.222679
> لگبا جی، ویلنیوفا اے جگر کینسر میں مائع بایپسی. دریافت طب 2015؛ 19 (105): 263-73.
> مائع بائیسسی: خون میں ڈی این اے کا استعمال کرتے ہوئے، ٹریک، اور کینسر کا علاج کرنے کا استعمال. این آئی ایچ.
> Umetani N، et al. پلازما کے مقابلے میں سیروم میں مفت گردش ڈی این اے کی زیادہ مقدار بنیادی طور پر علیحدگی کے دوران آلودگی سے متعلق بیرونی ڈی این اے کی وجہ سے نہیں ہے. این نیوی Acad اسکائی. 2006؛ 1075: 29 9-307.
> ویلسٹن اے کینسر کے فارماستھتھراپی میں عام اصول. میں: برنٹن ایل ایل، ہلال ڈانڈن آر، Knollmann BC. ایڈیشن Goodman & Gilman کی: دواسازی کی دوا، 13e نیویارک، نیویارک: McGraw ہل.